L’Oratorio del Calvario o della Crocifissione, dedicato anche ai SS Giacomo e Cristoforo era il principale dei sette oratori dell’isola. Fu fatto costruire su commissione del cardinale Alessandro Farnese il giovane nel 1588. L’anno prima di morire, come mausoleo di famiglia. 

L’oratorio sorse in sostituzione alla preesistente chiesa dedicata a San Giovanni Battista affidata ai frati Minori Osservanti nel 1431 da papa Eugenio IV in un breve. Ci fu l’approvazione di Ranuccio Farnese il vecchio.

Ai lavori di ricostruzione della chiesa e della costruzione dell’annesso convento dei frati Minori contribuirono certamente anche i Farnese che decisero di realizzare i sepolcri di famiglia in una della cappella della chiesa di San Giovanni.

Si vede ancora la tomba monumentale che Ranuccio Farnese il vecchio fece realizzare nel 1499, l’anno prima della sua morte, per se e per la sua famiglia, rimontata nel nuovo Oratorio del Monte Calvario.

Qui riposano le spoglie di Ranuccio Farnese il vecchio, Pier Luigi Farnese, la moglie Gerolama Orsini, il figlio cardinal Ranuccio Farnese.

Invano è stata cercata la tomba di Clelia Farnese, della figlia segreta del cardinale Alessandro Farnese il giovane, sull’isola.